Состав Контрольно-счетной палаты Новосибирской области определен статьей 3 Закона Новосибирской области от 07.11.2011 № 131-ОЗ «О Контрольно-счетной палате Новосибирской области». Постановлением Законодательного Собрания Новосибирской области от 25.11.2021 № 214 определена структура палаты и установлена её штатная численность.