Аудиторское направление в составе: аудитора Козловой Натальи Ивановны, главного инспектора Евсюковой Натальи Анатольевны, старшего инспектора  Борцова Олега Анатольевича, инспекторов Баженовой Алены Валерьевны и Новик Натальи Валерьевны осуществляет контроль за использованием бюджетных средств, выделенных на: 

-реализацию общих функций государственного управления, средства массовой информации, осуществление молодежной политики, культуру, физическую культуру и спорт, информатизацию;

-правоохранительную деятельность, пожарную безопасность и гражданскую оборону, предупреждение и ликвидация последствий стихийных бедствий и чрезвычайных ситуаций.

Кроме того, осуществляет контроль за управлением и распоряжением имуществом и интеллектуальной собственностью Новосибирской области, администрированием неналоговых доходов от соответствующей деятельности.